داستان انیمیشن لینک گمشده ، درباره یک کارشناس است به نام آقای لیونل فراست است که که رشته شغلی او شناخت موجودات اسطوره ای است؛ اما هیچکس در جامعه، حتی اطرافیانش رشته شغلی او را جدی نمی گیرند و به آن اهمیتی نمی دهند؛ تا اینکه سبک زندگی ماجراجویانه او همه چیز را به نفعش تغییر می دهد و ...